برای دسترسی به سایت قدیم به این آدرس مراجعه نمایید
سلام مهمان , ورود

مرکز پردازش سریع دانشگاه صنعتی شریف

نمونه خدمات

در سال‌های اخیر، مرکز پردازش سریع دانشگاه در جهت کمک به حل مسائل کلیدی کشور، اقدام به ارائه خدمات پردازش سریع در مقیاس بالا نموده‌است. از جمله خدمات این مرکز می‌توان به خدمات پردازشی جهت مبارزه با ویروس کرونا اشاره کرد.


طراحی داروهای ضد سرطان با عوارض جانبی کمتر با استفاده از خدمات مرکز پردازش سریع دانشگاه صنعتی شریف

تا کنون شواهد زیادی از موفقیت طراحی دارویی با روش های شیمی محاسباتی ارائه شده است که نشان می‌دهند که محاسبات کامپیوتری در زمینه توسعه دارو نقش مهمی را در حال حاضر ایفا می‌کند. طراحی اولیه ساختارهای دارویی با روش های محاسباتی برای مهار گونه های سرطان...

بیشتر

تا کنون شواهد زیادی از موفقیت طراحی دارویی با روش های شیمی محاسباتی ارائه شده است که نشان می‌دهند که محاسبات کامپیوتری در زمینه توسعه دارو نقش مهمی را در حال حاضر ایفا می‌کند. طراحی اولیه ساختارهای دارویی با روش های محاسباتی برای مهار گونه های سرطان زا، در حقیقت روشی است که مسیر رسیدن به یک ماده دارویی را تسهیل می‌کند. برای مثال، توسعه روش های دینامیک مولکولی که امکان مطالعه رفتار پروتئین هایی که در فرایند متاستازتومورها در بیماری سرطان نقش دارند از جمله کاربردهای روش های شیمی محاسباتی هستند. اما چون در برهم کنش های پروتئین ها و داروها، تاشدگی پروتئین ها، که در آن ساختار سه‌بعدی پلی‌پپتیدهای سازندۀ پروتئین دچار تغییر می‌شود، و این فرایند تاشدگی پروتئین در زمانی در حدود میلی ثانیه تا میکرو ثانیه انجام می‌شود، به منظور مطالعه رفتار پروتئین ها و برهم کنش آن ها با استفاده از شبیه سازی های مولکولی نیاز به انجام بیش از هزاران واحد محاسباتی GPU و هزاران ساعت انجام محاسبات کامپیوتری مبتنی بر CPU می‌باشد. گروه تحقیقاتی آزمایشگاه شیمی فیزیک آلی دانشکده شیمی دانشگاه صنعتی شریف که بر روی مطالعات کامپیوتری در زمینه طراحی ساختارهای دارویی جدید ضد سرطان با خواص اثر بخشی بهبود یافته و عوارض جانبی کمتر در مقایسه با داروهای موجود در بازار و قدیمی ضدسرطان متمرکز است، تاکنون بخش عمده ای از کارهای پردازشی و محاسباتی گروه تحقیقاتی خود را بر روی سامانه پردازش سریع دانشگاه صنعتی شریف به مرحله اجرا در آورده است. هم چنین این گروه علاوه بر انجام پروژه های طراحی داروهای ضد سرطان در زمینه طراحی مهارکننده‌ هایی برای ویروس کرونا و هم چنین انجام پروژه های موفق در زمینه بررسی تغییرات ساختاری باز‌‌های DNA در هنگام جهش های ژنتیکی از طریق محاسبات کامپیوتری پرداخته است. اکثر پروژه های تحقیقاتی این گروه در حال حاضر مبتنی بر خدمات پردازش سریع مرکز HPC دانشگاه صنعتی شریف است.

بستن

شبیه سازی کوانتومی و دینامیک مولکولی بر روی داروی پیشنهادی در درمان کرونا

در ماه‌های نخست فراگیری ویروس کرونا در جهان، داروهای هیدروکسی کلروکین به عنوان داروی موثر برای درمان پیشنهاد شد. که متاسفانه عوارض جانبی این دارو در تست‌های بالینی منجر به حذف آنها از دسته داروهای موثر برای درمان بیماری در برخی کشورها گردید از این رو...

بیشتر

در ماه‌های نخست فراگیری ویروس کرونا در جهان، داروهای هیدروکسی کلروکین به عنوان داروی موثر برای درمان پیشنهاد شد. که متاسفانه عوارض جانبی این دارو در تست‌های بالینی منجر به حذف آنها از دسته داروهای موثر برای درمان بیماری در برخی کشورها گردید از این رو تحقیقات در زمینه استفاده مؤثر از این دارو آغاز شد. در این راستا در ماههای اول شروع پاندمی گروه محاسباتی دانشکده شیمی دانشگاه صنعتی شریف پروهش مشترکی را با گروه تحقیقاتی دانشگاه یونیسا آفریقای جنوبی آغاز کردند. هدف اصلی این پروژه استفاده از نانو ذرات فلزات نجیب شامل نقره، طلا و پلاتین که دارای خواص ضد ویروسی و ضد باکتریایی هستن به عنوان حامل‌های دارویی و نشان دادن توانایی این نانوذرات در حمل مؤثر داروی هیدروکسی کلروکین بود. حمل دارو با نانوذرات منجر به کاهش عوارض جانبی و عملکرد گزینش‌پذیر دارو میگردد. در این پژوهش تلاش شد با کمک روش‌های محاسبات کوانتومی و دینامیک مولکولی، توانایی جذب داروی هیدروکسی کلروکین بر روی نانوذرات در غلظت‌های متفاوت از دارو و همچنین اندازه‌های متفاوت نانوذرات، مورد مطالعه قرار گیرد و توان محاسباتی ابر رایانه دانشگاه شریف این امکان را فراهم که محاسبات در کمترین زمان ممکن انجام شود. نتایج حاصل از این تحقیق در مجله Nature Scientific Reports پذیرفته شده است.

بستن

خدمات ارائه شده جهت مبارزه با ویروس کرونا

با توجه به نیاز مبرم پژوهشگران کشور به خدمات پردازشی جهت مطالعه ویروس کرونا و یافتن راه‌های پیشگیری و درمان آن، این مرکز اقدام به ارائه خدمات با اولویت بالا به پژوهشگران مذکور نموده است که جمع خدمات مورد استفاده ایشان ۱۳۰۰۰ واحد ساعت محاسبات مبتنی بر...

بیشتر

با توجه به نیاز مبرم پژوهشگران کشور به خدمات پردازشی جهت مطالعه ویروس کرونا و یافتن راه‌های پیشگیری و درمان آن، این مرکز اقدام به ارائه خدمات با اولویت بالا به پژوهشگران مذکور نموده است که جمع خدمات مورد استفاده ایشان ۱۳۰۰۰ واحد ساعت محاسبات مبتنی بر GPU و بیش از ۸۰۰۰۰ هسته ساعت محاسبات مبتنی بر CPU می باشد. به طور خاص، یکی از پروژههای ملی تشخیص کرونا تمامی کارهای پردازشی خود را بر روی سامانه HPC دانشگاه شریف اجرا نموده و با انجام ایشان بیش از ۵۰۰۰ واحد ساعت محاسبات مبتنی بر GPU و بیش از ۱۰۰۰۰ هسته ساعت محاسبات مبتنی بر CPU همچنان خدمات خود را بر بستر این مرکز ارائه مینماید. با شیوع ویروس کوید ۱۹ و همه گیر شدن آن در سطح جهان، تشخیص این ویروس، یکی از اولویتهای اصلی در ایران و همچنین سازمان‌های بین‌المللی همچون WHO قرار گرفته است. برای تشخیص این بیماری در حال حاضر چندین روش وجود دارد، ولی یکی از بهترین روش‌ها که طبق نظر متخصصین این حوزه دقت بیشتر و هزینه کمتری دارد استفاده از تصاویر سی تی اسکن قفسه سینه برای تشخیص پنومونی کوید ۱۹ می‌باشد. گروه تحقیقاتی آی‌مِد متشکل از دانشجویان و فارغ‌التحصیلان دانشگاه صنعتی شریف است که تحت نظر رییس پژوهشکده فناوری اطلاعات و ارتباطات پیشرفته دانشگاه صنعتی شریف (دکتر حمیدرضا ربیعی)، با همکاری دکتر حسین قناعتی استاد رادیولوژی، و همکاری دانشگاه‌های علوم پزشکی تهران، ایران، اصفهان و کرمان، و با حمایت مرکز نوآوری پژوهشکده فناوری اطلاعات و ارتباطات پیشرفته دانشگاه صنعتی شریف، و معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری، موفق به توسعه سامانه‌ای هوشمند به عنوان دستیار متخصصین رادیولوژی گردیده است که سرعت و دقت تشخیص کوید ۱۹ را از طریق پردازش تصاویر سی تی اسکن قفسه سینه افزایش می‌دهد. خدمات این گروه در حال حاضر مبتنی بر خدمات پردازش سریع مرکز HPC دانشگاه صنعتی شریف به بیش از ۱۰ دانشگاه علوم پزشکی کشور در حال ارائه میباشد. خدمات این گروه بر روی سایت http://aimed-sharif.ir قابل دسترسی میباشد.

بستن